黑龍江中醫藥大學附屬第一醫院兒科于2001年4月被批準為國家中醫藥管理局重點學科協作單位，是衛生部國家藥品監督管理局臨床藥理基地專業科室，黑龍江省中醫臨床研究基地重點建設科室，中醫兒科碩士研究生授權點，黑龍江省中醫兒科繼續教育基地,黑龍江中醫藥大學校級重點學科，黑龍江省中西醫結合學會兒科呼吸病學會主任單位。現已成為黑龍江省中醫兒科學醫療、教學、科研的指導中心。兒科年門診患者量7萬余人次，年收治住院患兒總數3500余人，兒科病房現有床位編制60張。兒科門診設有專家診室3個，普通診室1個、門診靜點室2個、門診采血室1個。中藥使用率達75%以上。
2015年9月科室引進電腦中頻藥物導入治療儀，該儀器是指在電場力的作用下，把藥物電解成離子狀態，利用同性相斥，異性相吸的特性，將藥物離子引入人體內的給藥方法。其配套的電極片與治療設備相結合，可使導藥功能在病變組織處維持時間長、濃度高，提高了有效成分對靶組織的作用；臨床使用中無痛苦、無創傷、安全、方便；避免了口服及注射給藥對患者的危害，減少痛苦及不便；避免了藥物對患者肝臟及胃腸道的影響，減少個體差異；在血中無血藥濃度峰谷現象，避免全是副作用。臨床中可應用于我科肺炎、腹瀉、上感、咳喘、支氣管炎、厭食、遺尿等疾病。
